Cell Rep Med |?許釗葳/江何偉團(tuán)隊(duì)基于胃專病隊(duì)列揭示胃部核心菌群和干預(yù)靶點(diǎn)

長(zhǎng)期以來(lái)，胃因強(qiáng)酸和消化酶環(huán)境被認(rèn)為不利于微生物定植，但高通量測(cè)序逐漸揭示其具有穩(wěn)定而復(fù)雜的微生態(tài)結(jié)構(gòu)。幽門螺桿 菌 雖是胃部疾病的重要病原體，卻難以完全解釋疾病進(jìn)展差異。胃部菌群是否存在穩(wěn)定的核心網(wǎng)絡(luò)，并參與胃黏膜損傷與疾病演進(jìn)，成為亟待回答的關(guān)鍵問(wèn)題。

近日， 福建醫(yī)科大學(xué)與臨港實(shí)驗(yàn)室 合作 在 Cell Reports Medicine 上發(fā)表研究成果： Core gastric microbiota linked to pathogenesis and preserved across age stratified cohorts 。 本研究 依托 胃專病 隊(duì)列 ，利用三代全長(zhǎng)擴(kuò)增子測(cè)序及宏基因組測(cè)序，解析了在人體全生命周期中穩(wěn)定存在的胃部微生態(tài)網(wǎng)絡(luò)，并鑒定出具備保護(hù)作用的模塊，初步證實(shí)了其作為胃黏膜修復(fù)潛在干預(yù)靶點(diǎn)。

研究團(tuán)隊(duì)對(duì) 255 名接受胃鏡檢查的兒童及青少年胃 黏膜刷檢樣本 開展全長(zhǎng) 16S rRNA 和 ITS 擴(kuò)增子測(cè)序，結(jié)合系統(tǒng)生物學(xué)和網(wǎng)絡(luò)分析，鑒定出由 11 個(gè)核心細(xì)菌屬組成的胃部核心微生態(tài)網(wǎng)絡(luò)。該網(wǎng)絡(luò)包含兩個(gè)相互拮抗的模塊： CST1A 和 CST1B 。 CST1A 在無(wú)潰瘍對(duì)照中富集，具有保護(hù)性特征； CST1B 則與胃十二指腸疾病相關(guān)，提示風(fēng)險(xiǎn)屬性。真菌測(cè)序顯示，胃黏膜中缺乏穩(wěn)定的真菌網(wǎng)絡(luò)參與；進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)，幽門螺桿 菌 感染可抑制 CST1A 模塊，加重胃部微生態(tài)失衡。

圖 . 胃部核心微生態(tài)網(wǎng)絡(luò)的識(shí)別與驗(yàn)證

該核心 網(wǎng)絡(luò)在不同分類層級(jí)上均呈穩(wěn)定的拮抗結(jié)構(gòu)。功能預(yù)測(cè)顯示， CST1A 主要涉及細(xì)胞運(yùn)動(dòng)和脂肪酸降解， CST1B 則偏向氨基糖代謝和肽聚糖生物合成，二者在生態(tài)位和功能層面的互補(bǔ)對(duì)立共同構(gòu)成胃黏膜表面的蹺蹺板式穩(wěn)態(tài)網(wǎng)絡(luò)。

為驗(yàn)證其干預(yù)潛力，選擇 CST1A 代表菌株 Achromobacter spanius ( A . spanius ) 開展功能實(shí)驗(yàn)。在乙醇誘導(dǎo)的 GES-1 胃上皮損傷模型中， A. spanius 預(yù)處理可下調(diào)炎癥、免疫、凋亡及 MAPK/JAK-STAT 相關(guān)通路；在 吲哚美辛 誘導(dǎo)的小鼠胃黏膜損傷模型中， A. spanius 可在胃組織定植，并減輕黏膜損傷和中性粒細(xì)胞浸潤(rùn)，伴隨 IL- 6 等促炎因子 下降趨勢(shì)，提示其可能通過(guò)調(diào)節(jié)炎癥反應(yīng)發(fā)揮黏膜保護(hù)作用。

進(jìn)一步整合亞洲、歐洲和南美洲 8 個(gè)獨(dú)立 人群 隊(duì)列、共 1,299 名受試者進(jìn)行驗(yàn)證，覆蓋兒童十二指腸潰瘍及成人胃癌 / 癌前病變?nèi)巳骸＝Y(jié)果顯示， CST1A-CST1B 拮抗拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)在不同隊(duì)列和疾病狀態(tài)中保持保守；基于 該核心 網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建的機(jī)器學(xué)習(xí)模型在獨(dú)立隊(duì)列中表現(xiàn)出良好的疾病分類和風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)能力。

綜上，該研究定義了 跨年齡 保守存在的胃部核心微生態(tài)網(wǎng)絡(luò)，為理解胃部疾病從單一病原體致病向微生態(tài)網(wǎng)絡(luò)失衡轉(zhuǎn)變提供了新框架，也為保護(hù)性核心菌群干預(yù)胃黏膜炎性損傷提供了候選靶點(diǎn)和實(shí)驗(yàn)依據(jù)。

本項(xiàng)研究的共同第一作者是 福建醫(yī)科大學(xué) 碩士研究生 黃 偉東 、 本科生 陳秋錦以及 福建省兒童醫(yī)院 高 學(xué) 杰 ； 福建醫(yī)科大學(xué) 許釗葳 副 研究員 、林旭教授 、 臨港實(shí)驗(yàn)室 江 何 偉研究員為本文共同通訊作者。

https://www.cell.com/cell-reports-medicine/fulltext/S2666-3791(26)00322-8

江何偉團(tuán)隊(duì)誠(chéng)聘助理研究員、博士后，核心圍繞臨床 隊(duì)列、化學(xué)蛋白質(zhì)組 學(xué)開展 藥物靶標(biāo)、疾病生物標(biāo)志物挖掘等前沿研究。

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