近日,東南大學(xué)生命健康高等研究院、東南大學(xué)附屬中大醫(yī)院高山教授研究團(tuán)隊在Developmental Cell雜志發(fā)表題為“P5CS represses tumor progression via inhibiting assembly of 48S pre-translation initiation complex”的研究論文。該研究突破了“P5CS僅作為代謝酶執(zhí)行催化功能”的傳統(tǒng)認(rèn)知,首次發(fā)現(xiàn)并鑒定P5CS為非經(jīng)典RNA結(jié)合蛋白(RBP),系統(tǒng)闡釋了其通過RNA結(jié)合活性直接參與蛋白翻譯網(wǎng)絡(luò)與腫瘤調(diào)控的新機(jī)制。東南大學(xué)博士生張晴晴為第一作者,高山教授為唯一通訊作者。
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據(jù)介紹,代謝酶在腫瘤進(jìn)展過程中頻繁發(fā)生表達(dá)或功能失調(diào)。傳統(tǒng)觀點認(rèn)為,代謝酶僅作為催化分子參與代謝通路的特定環(huán)節(jié),并通過表達(dá)水平或酶活性的改變影響腫瘤進(jìn)展。然而,代謝酶的異常定位現(xiàn)象向這一單一催化功能認(rèn)知提出了挑戰(zhàn)。最新研究證實,部分關(guān)鍵代謝酶具備獨立于催化功能的非經(jīng)典功能,在腫瘤發(fā)生發(fā)展中扮演重要角色。
Δ1-吡咯啉-5-羧酸合成酶(Δ1-pyrroline-5-carboxylate synthase,P5CS)由ALDH18A1基因編碼,在線粒體中催化谷氨酸生成谷氨酸半醛,是脯氨酸、鳥氨酸和精氨酸代謝途徑的關(guān)鍵酶。目前,關(guān)于P5CS腫瘤中的功能研究存在促癌和抑癌兩種看似矛盾的報道:一方面,P5CS在黑色素瘤、神經(jīng)母細(xì)胞瘤及肝細(xì)胞癌中發(fā)揮促癌功能;另一方面,低水平的ALDH18A1 mRNA表達(dá)與子宮內(nèi)膜癌和胃癌患者的生存率下降相關(guān),提示P5CS的抑癌作用。然而,這一相悖功能背后的分子機(jī)制尚不清晰。
RNA結(jié)合蛋白是基因轉(zhuǎn)錄后命運的核心調(diào)控因子。近年來,大規(guī)模RNA-RBP互作組學(xué)數(shù)據(jù)持續(xù)鑒定出代謝酶作為潛在的非經(jīng)典RBP,提示代謝酶具備作為RBP直接發(fā)揮基因表達(dá)調(diào)控的潛在功能。研究團(tuán)隊通過整合這些數(shù)據(jù),篩選并證實P5CS是一個非經(jīng)典RBP:其第150-159位氨基酸構(gòu)成非經(jīng)典RNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域(RBD),可直接結(jié)合靶標(biāo)mRNA,且該活性獨立于其催化功能。通過RIP-seq和LACE-seq, 研究人員系統(tǒng)鑒定了P5CS結(jié)合RNA譜系,富集分析發(fā)現(xiàn)這些基因富集于腫瘤相關(guān)通路中。
細(xì)胞實驗和小鼠皮下移植瘤實驗證實,在腫瘤細(xì)胞中P5CS以酶活性非依賴、RNA結(jié)合活性依賴的方式負(fù)向調(diào)控腫瘤細(xì)胞的生長、增殖和轉(zhuǎn)移。這一表型數(shù)據(jù)提示P5CS的RNA結(jié)合活性介導(dǎo)了其關(guān)鍵的抑癌功能。同時,研究團(tuán)隊在臨床肺癌和胃癌組織樣本中一致地觀察到P5CS在腫瘤組織樣本中的低表達(dá),進(jìn)一步支持該RNA結(jié)合功能具有潛在的臨床相關(guān)性。
機(jī)制研究表明,P5CS同時結(jié)合靶標(biāo)mRNA的5′ UTR及翻譯起始因子eIF3a/eIF3d,在空間上阻礙43S翻譯前起始復(fù)合物(PIC)接近mRNA m7G帽子結(jié)構(gòu),并破壞48S PIC組裝所需的eIF3-eIF4G這一關(guān)鍵蛋白互作,從而阻斷mRNA向43S PIC的招募,實現(xiàn)翻譯起始抑制與后續(xù)蛋白合成下調(diào)。這一機(jī)制揭示了線粒體外定位的P5CS作為RNA結(jié)合蛋白在翻譯起始復(fù)合物組裝調(diào)控中的新功能。
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P5CS通過其RNA結(jié)合活性發(fā)揮翻譯抑制和腫瘤抑制功能作用模式圖
該研究首次發(fā)現(xiàn)并鑒定代謝酶P5CS為非經(jīng)典RNA結(jié)合蛋白,揭示了其非酶活依賴的RNA結(jié)合功能在腫瘤抑制中的新機(jī)制。P5CS通過選擇性結(jié)合促癌基因mRNA并抑制其翻譯起始,重塑腫瘤細(xì)胞翻譯網(wǎng)絡(luò)進(jìn)而限制腫瘤生長。這一發(fā)現(xiàn)將P5CS與翻譯調(diào)控過程直接聯(lián)系起來,揭示了P5CS在代謝功能之外與基因表達(dá)調(diào)控的直接關(guān)聯(lián),同時為理解P5CS在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的雙重角色提供了理論依據(jù),并提示靶向P5CS的RNA結(jié)合功能有可能成為腫瘤治療的新策略。(編輯 劉敏 校對 張藍(lán)予 編審 程守勤)
論文鏈接:
https://www.cell.com/developmental-cell/abstract/S1534-5807(26)00195-4
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