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RNA剪接(RNA splicing)是真核生物基因表達過程中不可或缺的步驟,而承擔這一過程的剪接體(spliceosome)則是由多個小核核糖核蛋白(snRNP)動態組裝形成的精密分子機器【1-3】。其中,U5 snRNP是剪接催化中心的重要組成部分,其成熟裝配過程受到嚴格調控【4, 5】。然而,U5 snRNP如何由裝配中間體進一步成熟,一直是RNA剪接領域尚未完全解決的問題。
近日,復旦大學張端午團隊在Nucleic Acids Research發表題為Neurochondrin promotes U5 snRNP maturation by regulating AAR2 release from PRPF8 的研究論文。該研究鑒定了Neurochondrin(NCDN)這一新的U5 snRNP裝配調控因子,揭示其通過促進裝配伴侶蛋白AAR2從PRPF8上的釋放,驅動U5 snRNP成熟;NCDN缺失則導致RNA剪接異常,并抑制膠質瘤細胞生長,為理解剪接體裝配機制及剪接相關疾病提供了新的理論依據。
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尋找U5 snRNP成熟的關鍵調控因子
近年來,R2TP復合物、ZNHIT2和ECD等多個裝配因子的發現不斷完善了U5 snRNP生物發生模型,但PRPF8–AAR2裝配中間體如何繼續向成熟U5 snRNP轉變,其分子機制仍不清楚。
研究團隊首先利用蛋白質組學和生化分析系統解析NCDN相互作用網絡,發現NCDN與PRPF8、EFTUD2、AAR2等多個U5 snRNP核心組分穩定結合,并能夠直接結合裝配伴侶AAR2。進一步研究表明,NCDN主要定位于細胞質,與U5 snRNP早期裝配過程相吻合,提示其可能參與U5 snRNP生物發生。
NCDN促進AAR2釋放,驅動U5 snRNP成熟
機制研究進一步揭示了NCDN在U5 snRNP成熟中的關鍵作用。作者發現,敲低NCDN后,成熟U5 snRNP及后續U4/U6·U5 tri-snRNP復合物明顯減少,而PRPF8與AAR2之間的結合顯著增強,說明裝配過程停留在PRPF8–AAR2中間體階段。相反,提高NCDN表達則促進AAR2從PRPF8上解離,加速成熟U5 snRNP形成。研究據此提出,NCDN并非傳統意義上的裝配支架,而是通過調控AAR2釋放推動U5 snRNP完成成熟,為U5 snRNP裝配機制補充了關鍵一環。
剪接異常連接U5 snRNP裝配缺陷與膠質瘤發生
轉錄組測序進一步顯示,NCDN缺失導致廣泛的可變剪接異常及基因表達重塑,涉及細胞增殖、凋亡等多條關鍵生物學通路。相應地,NCDN敲低顯著抑制膠質瘤細胞增殖并促進細胞凋亡。臨床數據庫分析進一步發現,NCDN在膠質瘤組織中高表達,且其高表達與患者較差的總體生存密切相關,提示NCDN可能成為膠質瘤等剪接依賴性腫瘤的潛在干預靶點。
該研究將NCDN與U5 snRNP生物發生聯系起來,闡明了其通過促進AAR2從PRPF8釋放、推動U5 snRNP成熟的新機制,進一步完善了RNA剪接體裝配的理論模型。同時,研究建立了U5 snRNP裝配異常、RNA剪接失衡與膠質瘤發生之間的聯系,為理解剪接體功能失調相關疾病及開發靶向RNA剪接的新型治療策略提供了新的思路。
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復旦大學生物醫學研究院任婷蓉博士為論文第一作者,張端午研究員為通訊作者。
原文鏈接:https://academic.oup.com/nar/article/54/13/gkag685/8725954
制版人:十一
參考文獻
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學術合作組織
(*排名不分先后)
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