微生物如何影響健康？2 篇高分文獻(xiàn)揭示口腔致病機(jī)制與宏基因組算法解析

2026 年徐振江團(tuán)隊(duì)在 Microbiome 上發(fā)表的一項(xiàng)研究表明牙齦卟啉單胞菌通過(guò)其毒力因子牙齦蛋白酶誘發(fā)腸道菌群失調(diào)并增強(qiáng) Th17 細(xì)胞介導(dǎo)的免疫反應(yīng)，從而加劇腸道炎癥[1]。同期，該團(tuán)隊(duì)另一項(xiàng)研究開(kāi)發(fā)了能系統(tǒng)預(yù)測(cè)細(xì)菌轉(zhuǎn)錄終止與 3' stem-loop 結(jié)構(gòu)的深度學(xué)習(xí)工具 BATTER，為在微生物群落層面解析轉(zhuǎn)錄調(diào)控提供了新的分析框架[2]。

同年，王帥等在 bioRxiv 預(yù)印本中開(kāi)發(fā)了 MODIFI 工具[3]，利用宏基因組長(zhǎng)讀長(zhǎng)的動(dòng)力學(xué)信號(hào)，在無(wú)需配對(duì)對(duì)照實(shí)驗(yàn)的條件下實(shí)現(xiàn) DNA 修飾位點(diǎn)與甲基化基序的識(shí)別，進(jìn)而完成菌株水平的宿主-元件關(guān)聯(lián)推斷，為在復(fù)雜群落中解析微生物表觀遺傳調(diào)控及宿主-元件互作提供了新的方法路徑。

這些前沿發(fā)現(xiàn)共同揭示了一個(gè)核心問(wèn)題：微生物如何通過(guò)分子層面的精密調(diào)控影響人體健康？為深入探討這一話題，華大科技將于 2026 年 8 月 18 日（周二）10:00～12:00 舉辦「大咖面對(duì)面 | 微生物組前沿：算法創(chuàng)新與疾病機(jī)制雙重突破」主題直播。特邀加州伯克利博士后王帥分享如何基于 PacBio HiFi 讀長(zhǎng)解析宏基因組 DNA 修飾圖譜與宿主-元件關(guān)聯(lián)；徐振江教授則將系統(tǒng)解讀口腔微生物時(shí)空動(dòng)態(tài)、下消化道疾病關(guān)聯(lián)及非編碼調(diào)控線索。現(xiàn)在報(bào)名參與直播，更有機(jī)會(huì)獲得保溫杯、蠑螈袋、洗漱包、文創(chuàng)禮包等精美禮品！

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直播亮點(diǎn)搶先看

王帥（加州大學(xué)伯克利分校 博士后研究員）

課程主題

宏基因組菌株水平 DNA 修飾圖譜解析

課程亮點(diǎn)

MODIFI 算法：宏基因組水平甲基化快速識(shí)別

基于甲基化特征的菌株級(jí)「宿主-元件」精準(zhǔn)追溯

從測(cè)序數(shù)據(jù)到甲基化分析和宿主元件相互作用分析應(yīng)用

未來(lái)拓展：甲基化對(duì)基因表達(dá)以及微生物適應(yīng)、演化的調(diào)節(jié)

徐振江（教授 博士生導(dǎo)師）

課程主題

口腔微生物時(shí)空動(dòng)態(tài)及其對(duì)下消化道疾病的影響

課程亮點(diǎn)

口腔微生物時(shí)空動(dòng)態(tài)與群落失衡機(jī)制解析

口腔微生物異位定植與下消化道疾病關(guān)聯(lián)

從「相關(guān)性」走向「分子機(jī)制」的研究新路徑

微生物轉(zhuǎn)錄終止子預(yù)測(cè)與非編碼調(diào)控注釋

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內(nèi)容策劃：沈佳鈺、劉青

內(nèi)容審核：朱卿

題圖來(lái)源：圖蟲(chóng)創(chuàng)意

參考文獻(xiàn)

[1] Li M, Cui J, Qu R, et al. Porphyromonas gingivalis induces intestinal inflammation through gingipain-dependent gut microbiome dysbiosis. Microbiome. 2026.

[2] Jin Y, Cui J, Liu R, et al. Conserved 3' stem-loop structures enable comprehensive analysis of bacterial transcription termination in metagenomes. Microbiome. 2026.

[3] Wang S, Guitor AK, Valentin-Alvarado LE, et al. Metagenomic strain-resolved DNA modification patterns link extrachromosomal genetic elements to host strains. bioRxiv. 2026