撰文丨王聰
編輯丨王多魚
排版丨水成文
大規模擾動圖譜已改變了系統生物學,然而人類心臟領域尚缺乏此類資源——對于心臟而言,收縮功能與轉錄組狀態必須同步測量。
2026 年 7 月 28 日,澳大利亞 QIMR Berghofer 醫學研究所的研究人員在 Cell 子刊Cell Stem Cell上發表了題為:Cardiopedia-Ligand: A ligand-receptor perturbation atlas of human cardiac organoid function and transcriptional state 的研究論文。
該研究繪制了人類心臟類器官功能與轉錄狀態的配體-受體擾動圖譜——Cardiopedia-Ligand。
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在這項最新研究中,研究團隊建立了一個綜合性的擾動-功能-轉錄組圖譜——Cardiopedia-Ligand,通過用 87 種配體(靶向人類心臟表達的 98 種細胞膜受體)刺激人類心臟類器官(hCO)生成。研究團隊開發了一套自動化高通量流程,可實現個體化收縮力測量及單個類器官 mRNA 測序。
利用該流程,研究團隊定義了已知及此前未被識別的功能和轉錄聚類,包括正性肌力藥物(增強心肌收縮力)、內皮素肽(收縮血管)、細胞外基質調控因子及多個炎癥相關聚類。聚類分析、機器學習及人類心力衰竭活檢組織的“指紋圖譜”分析揭示了配體之間此前被低估的相似性,以及一種驅動射血分數保留型心力衰竭(HFpEF)的干擾素-γ 信號特征。
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該研究的亮點:
87 種可溶性配體的功能及轉錄組擾動篩選;
表型、功能和轉錄聚類的鑒定;
炎癥配體的差異性轉錄特征鑒定;
機器學習與配體指紋識別揭示疾病驅動因素。
總的來說,這一全面的 Cardiopedia-Ligand 數據集為探究心臟生物學與人類疾病提供了寶貴且易獲取的資源。
論文鏈接:
https://www.cell.com/cell-stem-cell/fulltext/S1934-5909(26)00264-X
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